水環境に関連した特定のテーマについて、専門家を集めた産官学協同の研究委員会を設置し、シンポジウムや講演会および見学会の開催などを通じて、水環境関連分野の研究・技術開発の促進を行っています。現在、以下の17研究委員会（平成20年度末現）が精力的に活動しています。

• MS技術
• 嫌気性微生物処理
• 産業排水の処理・回収技術
• 紫外線を利用した水処理技術
• 湿地・沿岸域
• 水中の健康関連微生物
• 生物膜法
• 土壌地下水汚染
• ノンポイント汚染

• バイオアッセイによる安全性評価
• ポピュレーションダイナミクス
• 膜を利用した水処理技術
• 身近な生活環境
• 水環境教育（WEE21）
• 水環境と洗剤
• 水環境保全の国際協力
• 流域水環境ソリューション
• 水環境の総合指標